Objectifs de cette formation de 3 jours

Comprendre les principes fondamentaux du séquençage haut débit
Maîtriser les techniques et les étapes clés du séquençage haut débit
Analyser et interpréter les données générées par le séquençage haut débit

DURÉE

3 jours
soit 21 heures

PUBLIC

Technicien, Cadre, Biologiste, Ingénieur, Chercheur

PRÉ-REQUIS

Connaissances de base en biologie moléculaire et en PCR

Programme de la formation

Jour 1 - Matin

1. Expliquer les principes et les technologies du séquençage haut débit
  • Évolution du séquençage de l'ADN et introduction au séquençage haut débit
  • Comparaison des principales technologies de séquençage haut débit : Illumina, Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore, etc.
  • Principe de base de la génération de données de séquençage haut débit
2. Décrire les étapes pré-séquençage
  • Extraction et purification de l'ADN ou de l'ARN à partir d'échantillons biologiques
  • Préparation des bibliothèques d'ADN ou d'ARN pour le séquençage
  • Contrôles de qualité et quantification des échantillons avant le séquençage

Jour 1 - Après-midi

3. Décrire les étapes de séquençage
  • Introduction aux techniques d'amplification et de clonage pour l'amplification des échantillons avant le séquençage
  • Utilisation des plates-formes de séquençage haut débit pour la génération de données
  • Principe de la lecture des séquences et de la génération des signaux

Jour 2 - Matin

4. Analyser les données de séquençage haut débit
  • Contrôle qualité des données brutes et filtrage des séquences de mauvaise qualité
  • Alignement des lectures sur un génome de référence ou assemblage de novo des séquences
  • Analyse des variants génétiques, détection des mutations, et annotation des résultats

Jour 2 - Après-midi

5. Interpréter les résultats et analyser les données
  • Étude de l'expression génique différentielle et de la régulation des gènes par le séquençage RNA-Seq
  • Analyse des variations génétiques, des mutations somatiques et de la variation de l'ADN
  • Exploration des données épigénétiques et des modifications de la chromatine par le séquençage ChIP-Seq ou Bisulfite-Seq
Dernière date de modification : 2023-07-04

Pédagogie

Méthodes pédagogiques :

Alternance de méthodes pédagogiques variées, adaptées aux différentes compétences à acquérir. Des cours magistraux permettront aux stagiaires d'acquérir les connaissances théoriques nécessaires, tandis que des travaux pratiques leur permettront de se familiariser avec les techniques d'analyse et de diagnostic. Des études de cas seront également proposées, afin d'encourager les stagiaires à développer leur esprit d'analyse et de synthèse.

Modalités d’évaluation :

Une évaluation formative sera réalisée tout au long du programme afin de permettre aux formateurs de fournir un retour régulier aux participants et de les aider à progresser dans leur apprentissage. Elle pourra prendre la forme d'exercices pratiques, de discussions de groupe ou de QCM.

Sessions INTRA : Villes dans lequelles nous organisons la formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique

Formation Code Postal Département
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Paris 75000 Paris
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Marseille 13000 Bouches-du-Rhône
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Toulouse 31500 Haute-Garonne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Bordeaux 33300 Gironde
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Montpellier 34000 Hérault
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Lille 59800 Nord
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Strasbourg 67000 Bas-Rhin
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Lyon 69000 Rhône
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Toulon 83200 Var
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Grenoble 38000 Isère
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Nantes 44200 Loire-Atlantique
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Dijon 21000 Côte-d'Or
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Nimes 30000 Gard
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Rennes 35000 Ille-et-Vilaine
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Saint Etienne 42000 Loire
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Orleans 45000 Loiret
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Clermont Ferrand 63000 Puy-de-Dôme
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Annecy 74000 Haute-Savoie
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Versailles 78000 Yvelines
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Avignon 84000 Vaucluse
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Evry 91000 Essonne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Nanterre 92000 Hauts-de-Seine
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Saint Denis 93200 Seine-Saint-Denis
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Angers 49000 Maine-et-Loire
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Brest 29200 Finistère
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Metz 57050 Moselle
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Caen 14000 Calvados
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Mulhouse 68100 Haut-Rhin
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Nancy 54100 Meurthe-et-Moselle
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique La Rochelle 17000 Charente-Maritime
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Agen 47000 Lot-et-Garonne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Albi 81990 Tarn
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Alençon 61000 Orne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Amiens 80090 Somme
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Angoulême 16000 Charente
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Argenteuil 95100 Val-d'Oise
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Arras 62000 Pas-de-Calais
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Auch 32810 Gers
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Aurillac 15000 Cantal
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Auxerre 89000 Yonne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Belfort 90000 Territoire de Belfort
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Besançon 25000 Doubs
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Blois 41000 Loir-et-Cher
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Bourg en Bresse 01000 Ain
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Bourges 18000 Cher
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Cahors 46000 Lot
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Carcassonne 11000 Aude
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Châlons en Champagne 51000 Marne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Chambéry 73000 Savoie
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Chartres 28000 Eure-et-Loir
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Châteauroux 05380 Hautes-Alpes
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Colmar 68000 Haut-Rhin
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Créteil 94000 Val-de-Marne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Digne les Bains 04000 Alpes-de-Haute-Provence
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Epinal 88000 Vosges
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Evreux 27000 Eure
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Gap 05000 Hautes-Alpes
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Guéret 23000 Creuse
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique La Roche sur Yon 85000 Vendée
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Laval 53000 Mayenne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Le Mans 72100 Sarthe
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Limoges 87280 Haute-Vienne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Mâcon 71870 Saône-et-Loire
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Melun 77000 Seine-et-Marne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Mende 48000 Lozère
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Montauban 82000 Tarn-et-Garonne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Moulins 03000 Allier
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Nevers 58000 Nièvre
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Niort 79000 Deux-Sèvres
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Périgueux 24000 Dordogne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Perpignan 66100 Pyrénées-Orientales
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Poitiers 86000 Vienne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Quimper 29000 Finistère
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Reims 51100 Marne
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Rodez 12000 Aveyron
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Rouen 76100 Seine-Maritime
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Saint Brieuc 22000 Côtes-d'Armor
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Saint Lô 50000 Manche
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Tarbes 65000 Hautes-Pyrénées
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Tours 37100 Indre-et-Loire
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Valence 26000 Drôme
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Vannes 56000 Morbihan
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Vesoul 70000 Haute-Saône
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Pau 64000 Pyrénées-Atlantiques
Formation Bases du séquençage haut débit : de la théorie à la pratique Mont de Marsan 40000 Landes