1. Le microbiote génital féminin : la biologie moléculaire à l’origine de nouvelles connaissances
- La composition et sa diversité génétique
- Les bactéries du microbiote d’intérêt médical : de l’espèce aux complexes clonaux
- Les bases moléculaires de la variabilité du pouvoir pathogène
- des bactéries du microbiote à haut risque infectieux
2. Mycoses, Vaginoses bactériennes et Vulvovaginites : les connaissances récentes moléculaires du microbiote valident le recours à des techniques de routine applicables dans tous les laboratoires
- Un bon prélèvement : responsabilité du microbiologiste dans la phase pré-analytique
- Classifier les flores vaginales au regard des connaissances récentes du microbiote vaginal
- Utiliser judicieusement les critères cliniques, cytologiques et bactériologiques dans la conduite de l’examen bactériologique
- d’un prélèvement vaginal
- Diagnostiquer efficacement les perturbations du microbiote vaginal (mycose, vaginose, et notion de portage) et les vulvovaginites à Trichomonas vaginalis.
- Les vaginites bactériennes ou « aerobic vaginitis » (Streptocoques du groupe B et A, Escherichia coli, Haemophilus etc …) : ne pas ignorer ces diagnostics mais aussi ne pas ignorer les affections graves dont ces profils microbiologiques peuvent témoigner.
3. Diagnostic des endocervicites et des Infections Génitales Hautes (IGH) : Les recommandations nationales de 2012 révisées en 2018 tardent à se mettre en place
- Une IGH : c’est quoi et quelles étiologies en fonction
- de la localisation ?
- Les critères majeurs et additifs de suspicion d’IGH : importance des critères microbiologiques additifs
- Faire des prélèvements de qualité : lesquels ? Comment juger de leur conformité ?
- Les techniques bactériologiques à utiliser et la place des Techniques d’Amplification des Acides Nucléiques (Mycoplasma genitalium, Neisseria gonorrhoeae, et Chlamydia trachomatis). Recommandations 2018.
4. Les infections materno-foetales : les recommandations de 2017 changent de paradigme et révisent la place du bilan microbiologique
- Physiopathologie et bactéries des infections materno-foetales
- Quel bilan pour documenter une infection materno-foetale bactérienne : place des frottis ottis amniotiques, placentoculture, liquide gastrique et prélèvements superficiels, hémocultures et LCR chez le nouveau-né
- Stratégies de prise en charge médicale du nouveau-né en 2020